基因組光學圖譜

 天津生物芯片于2012年引進國內首臺Argus基因組光學圖譜工作站,并配備了一套用于基因組光學圖譜指導序列拼接的軟件系統。該軟件系統能夠將基因組光學圖譜技術與原始測序數據有效結合,獲得高質量的全基因組序列圖譜。天津生物芯片結合公司已有的微生物圖譜信息庫,利用Argus基因組光學圖譜工作站可以高效、精確地將組裝的基因組序列定位到染色體上,可以完成真菌基因組“完成圖”測序,比較基因組及菌株分型等科研項目。

Argus 基因組光學圖譜工作站
Argus基因組光學圖譜工作站服務領域

"真菌基因組完成圖"測序完美解決方案

 

2012年至今,天津生物芯片技術有限責任公司與南開大學合作建立了基于OpGen公司的Argus系統的基因組光學圖譜工作站,并針對細菌、真菌和動植物進行了基因組光學圖譜(Optical Mapping)分析,并建立了成熟的從樣品處理到結果解析的標準操作流程。
高通量序列拼接結果矯正分析
   隨著測序技術的發展,完成測序的基因組越來越多,但由于基因組自身結構特點(雜合度和重復區等),以及測序技術及拼接原理局限性等原因(讀長和庫長較短),基因組錯拼事件經常發生。基因組光學圖譜技術因其拼接準確性較高被譽為評價基因組拼接質量的“金標準”,可以很好地矯正高通量測序拼接結果中的錯誤,特別是由于重復區造成的大尺度的錯拼。

指導序列拼接,顯著增加大型生物基因組序列拼裝質量
   與二代測序技術相結合,利用指導基因組光學圖譜序列拼接的軟件系統,以光學圖譜信息為構建Super-Scaffold,填充Gaps,增加測序覆蓋區域,降低大型生物基因組測序成本,增加基因組拼裝效果。
 大型生物基因組序列拼裝效果

 天津生物真菌研究技術路線

比較基因組及菌株分型
      通過基因組光學圖譜比較,快速地揭示基因組間的相似性和差異性、了解基因組結構變異。
 比較基因組及菌株分型
?   菌株鑒定
     結合天津生物芯片已有的微生物圖譜信息庫,通過圖譜比對,可以將微生物鑒定到菌株水平。

菌株水平 效果圖

更多應用問題請點擊基因組光學圖譜常見問題

天津生物芯片優勢
   2012年引進國內首臺Argus基因組光學圖譜工作站,并配備了一套用于基因組光學圖譜指導序列拼接的軟件系統;
   天津生物芯片技術有限責任公司與南開大學合作,建立了成熟的從樣品處理到結果解析的標準操作流程;
   實驗室從2012年7月引進該平臺至今,已經完成5株真菌和2株植物的基因組光學圖譜分析。
基因組光學圖譜工作原理

 

 

 
 基因組光學圖譜工作原理
 
 
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