宏基因組學

    宏基因組學( metagenomics)是一種以環境樣品中的微生物群體基因組為研究對象,以功能基因篩選和測序分析為研究手段,以微生物多樣性、種群結構、進化關系、功能活性、相互協作關系及與環境之間的關系等為研究目的的新的微生物研究方法,也稱為微生物環境基因組學、元基因組學或生態基因組學。主要研究從環境樣品獲得的基因組中所包含的微生物的遺傳組成及其群落功能,為充分認識和開發利用非培養微生物,并從完整的群落水平上認識微生物的活動、最大限度地挖掘微生物資源提供了可能。
    宏基因組de novo測序是指對環境樣品中所有微生物基因組DNA片段化后進行高通量測序,進行序列組裝和基因注釋,獲得部分不可純培養微生物的基因組序列,分析該環境下所有微生物基因集信息。
一、 技術路線:
 


二、信息學分析
1.標準信息學分析

1)原始數據整理、過濾及質量評估

2)基因集分析

3)物種豐度分析

4)群落結構分析

5)微生物基因組序列組裝和拼接

2.定制化信息學分析
可結合客戶的需求,協商確定定制化信息分析內容。


三、技術優勢
1. 擁有標準化操作實驗室和高通量測序技術平臺(Roche 454 FLX+、Illumina Solexa ),實驗周期短,質量可靠。
2. 擁有專業的宏基因組學技術人員,可以根據客戶的不同要求提供個性化實驗方案。
3. 擁有專業的生物信息團隊和大型計算機,可為客戶提供個性化的生物信息分析服務。


四、實驗周期
 從客戶獲得合格樣品后40個工作日內完成文庫構建、上機測序和生物信息學分析工作。


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