10x Genomics 系統

    近年來,已有多種單細胞測序技術及平臺應用而生,10x Genomics憑借其高細胞通量、極短項目周期及極低成本脫穎而出。10x Genomics 系統利用其獨有的液滴式文庫構建解碼技術,針對長片段序列進行等溫擴增并引入了barcode序列編輯單條DNA分子,再連接測序接頭形成完整文庫并進行Illumina測序,此項技術通過帶有相同barcode標簽的reads進行組裝,計算得到跨度在50-100Kb的linked-reads信息,從而獲得大片段的遺傳信息。這一技術彌補了二代測序平臺讀長短、無法獲取長片段信息的短板,在全基因組測序和外顯子組測序領域具有重要的應用價值。

    近日,天津生物芯片引進的10x Genomics 系統已到位,這此舉將進一步增強天津生物芯片在全球范圍的大規模基因組學服務能力,擴大基因組中心的國際影響力。通過提供多種測序平臺的協同服務,天津生物芯片全力服務合作伙伴,為生命科學多個領域,如農業、基礎研究、醫學和健康等領域的研究發展和成果轉化提供核心工具。

 

技術流程

微反應體系(Partitioning)與DNA序列標記(barcode)

 

1.將樣本分配到100,000s到1000,000s微反應體系,每個微反應體系含有一種特定的DNA序列標記。

2.含有barcode信息的凝膠珠子首先與樣品和酶的混合物混合,然后與位于微流體“雙十字”連接中的油表面活性劑溶液結合。

3.GEMs (包含樣品、酶、凝膠珠子的混合物油滴)流到儲液器中并進行收集。凝膠珠子溶解釋放barcode序列,開始對樣本進行標記。將每個液滴中含有barcode信息的產物混合。然后構建標準測序文庫。

 

技術優勢:


超高通量:單個樣本細胞檢測數最高可達1000-10000;
項目周期短:一天內即完成從細胞懸液到cDNA文庫構建所有的測序準備工作;
細胞捕獲效率高:單個細胞捕獲效率高達65%,可準確鑒別稀有細胞類型;
真正的單細胞測序:通過油滴-barcode-單細胞的對應關系,實現真正意義上的單細胞測序;
測序平臺兼容度廣:與Illumina各種型號的平臺高度兼容。

 

應用方向

 

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